Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
FANCAO15360 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
FANCAO15360 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
FANCAO15360 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
FANCAO15360 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
FANCAO15360 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
FANCAO15360 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
FANCAO15360 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
FANCAO15360 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
FANCAO15360 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
FANCAO15360 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
FANCAO15360 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
FANCAO15360 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
FANCAO15360 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
FANCAO15360 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
FANCAO15360 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
FANCAO15360 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
FANCAO15360 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
FANCAO15360 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
FANCAO15360 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
FANCAO15360 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
FANCAO15360 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
FANCAO15360 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
FANCAO15360 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
FANCAO15360 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
FANCAO15360 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
FANCAO15360 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
FANCAO15360 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
FANCAO15360 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
FANCAO15360 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
FANCAO15360 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
FANCAO15360 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
FANCAO15360 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
FANCAO15360 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
FANCAO15360 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
FANCAO15360 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
FANCAO15360 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
FANCAO15360 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
FANCAO15360 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
FANCAO15360 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
FANCAO15360 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
FANCAO15360 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
FANCAO15360 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
FANCAO15360 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
FANCAO15360 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC34■■■■□ 3.03
FANCAO15360 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
FANCAO15360 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
FANCAO15360 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
FANCAO15360 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
FANCAO15360 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
FANCAO15360 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
FANCAO15360 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
FANCAO15360 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
FANCAO15360 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
FANCAO15360 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
FANCAO15360 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
FANCAO15360 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
FANCAO15360 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
FANCAO15360 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
FANCAO15360 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
FANCAO15360 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
FANCAO15360 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
FANCAO15360 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
FANCAO15360 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
FANCAO15360 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
FANCAO15360 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
FANCAO15360 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
FANCAO15360 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
FANCAO15360 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
FANCAO15360 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
FANCAO15360 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
FANCAO15360 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
FANCAO15360 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
FANCAO15360 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
FANCAO15360 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
FANCAO15360 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
FANCAO15360 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.02
FANCAO15360 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
FANCAO15360 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
FANCAO15360 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
FANCAO15360 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
FANCAO15360 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.02
FANCAO15360 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
FANCAO15360 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
FANCAO15360 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
FANCAO15360 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
FANCAO15360 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
FANCAO15360 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
FANCAO15360 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
FANCAO15360 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
FANCAO15360 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
FANCAO15360 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
FANCAO15360 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
FANCAO15360 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
FANCAO15360 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
FANCAO15360 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
FANCAO15360 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
FANCAO15360 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
FANCAO15360 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
FANCAO15360 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms