Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBDO15205 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBDO15205 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBDO15205 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBDO15205 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBDO15205 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBDO15205 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBDO15205 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBDO15205 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBDO15205 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
UBDO15205 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBDO15205 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBDO15205 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBDO15205 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBDO15205 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
UBDO15205 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBDO15205 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBDO15205 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBDO15205 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBDO15205 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBDO15205 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBDO15205 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBDO15205 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBDO15205 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UBDO15205 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBDO15205 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBDO15205 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBDO15205 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UBDO15205 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UBDO15205 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBDO15205 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBDO15205 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBDO15205 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBDO15205 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBDO15205 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBDO15205 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBDO15205 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBDO15205 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBDO15205 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBDO15205 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBDO15205 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBDO15205 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBDO15205 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBDO15205 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBDO15205 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBDO15205 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBDO15205 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBDO15205 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBDO15205 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBDO15205 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UBDO15205 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBDO15205 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBDO15205 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBDO15205 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBDO15205 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBDO15205 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBDO15205 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBDO15205 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBDO15205 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBDO15205 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBDO15205 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBDO15205 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBDO15205 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBDO15205 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBDO15205 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBDO15205 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBDO15205 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBDO15205 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBDO15205 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
UBDO15205 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBDO15205 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBDO15205 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBDO15205 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBDO15205 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBDO15205 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBDO15205 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBDO15205 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBDO15205 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBDO15205 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBDO15205 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBDO15205 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBDO15205 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBDO15205 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBDO15205 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBDO15205 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBDO15205 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBDO15205 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBDO15205 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBDO15205 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBDO15205 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBDO15205 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBDO15205 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBDO15205 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
UBDO15205 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBDO15205 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBDO15205 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBDO15205 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBDO15205 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBDO15205 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBDO15205 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms