Protein–RNA interactions for Protein: O15111

CHUK, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHUKO15111 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHUKO15111 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHUKO15111 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHUKO15111 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHUKO15111 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHUKO15111 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHUKO15111 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHUKO15111 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHUKO15111 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHUKO15111 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHUKO15111 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHUKO15111 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHUKO15111 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHUKO15111 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHUKO15111 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHUKO15111 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHUKO15111 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHUKO15111 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHUKO15111 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHUKO15111 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHUKO15111 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHUKO15111 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHUKO15111 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHUKO15111 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHUKO15111 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHUKO15111 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHUKO15111 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHUKO15111 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHUKO15111 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHUKO15111 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHUKO15111 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHUKO15111 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHUKO15111 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHUKO15111 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHUKO15111 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHUKO15111 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHUKO15111 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHUKO15111 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHUKO15111 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHUKO15111 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHUKO15111 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHUKO15111 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHUKO15111 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHUKO15111 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHUKO15111 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHUKO15111 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHUKO15111 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHUKO15111 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHUKO15111 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHUKO15111 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHUKO15111 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHUKO15111 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHUKO15111 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHUKO15111 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHUKO15111 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHUKO15111 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHUKO15111 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHUKO15111 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHUKO15111 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHUKO15111 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHUKO15111 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHUKO15111 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHUKO15111 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHUKO15111 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHUKO15111 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHUKO15111 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHUKO15111 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHUKO15111 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHUKO15111 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHUKO15111 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHUKO15111 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHUKO15111 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHUKO15111 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHUKO15111 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHUKO15111 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHUKO15111 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHUKO15111 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHUKO15111 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHUKO15111 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHUKO15111 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHUKO15111 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHUKO15111 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHUKO15111 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHUKO15111 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHUKO15111 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHUKO15111 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHUKO15111 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHUKO15111 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHUKO15111 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CHUKO15111 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHUKO15111 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHUKO15111 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHUKO15111 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHUKO15111 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHUKO15111 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHUKO15111 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHUKO15111 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHUKO15111 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHUKO15111 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHUKO15111 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms