Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GIPC1O14908 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIPC1O14908 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms