Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms