Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EBAG9O00559 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms