Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GFRA2O00451 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms