Protein–RNA interactions for Protein: O00203

AP3B1, AP-3 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B1O00203 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms