Protein–RNA interactions for Protein: O00116

AGPS, Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPSO00116 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGPSO00116 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGPSO00116 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGPSO00116 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
AGPSO00116 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGPSO00116 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGPSO00116 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGPSO00116 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGPSO00116 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGPSO00116 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGPSO00116 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGPSO00116 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGPSO00116 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGPSO00116 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGPSO00116 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGPSO00116 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGPSO00116 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGPSO00116 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
AGPSO00116 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
AGPSO00116 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGPSO00116 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGPSO00116 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGPSO00116 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGPSO00116 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGPSO00116 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGPSO00116 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGPSO00116 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGPSO00116 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGPSO00116 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGPSO00116 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGPSO00116 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGPSO00116 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGPSO00116 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGPSO00116 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGPSO00116 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGPSO00116 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGPSO00116 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGPSO00116 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGPSO00116 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGPSO00116 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGPSO00116 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGPSO00116 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGPSO00116 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGPSO00116 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGPSO00116 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
AGPSO00116 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGPSO00116 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
AGPSO00116 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGPSO00116 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
AGPSO00116 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
AGPSO00116 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AGPSO00116 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AGPSO00116 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
AGPSO00116 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGPSO00116 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGPSO00116 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGPSO00116 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGPSO00116 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGPSO00116 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGPSO00116 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGPSO00116 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGPSO00116 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGPSO00116 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGPSO00116 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGPSO00116 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
AGPSO00116 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGPSO00116 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGPSO00116 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGPSO00116 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGPSO00116 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGPSO00116 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGPSO00116 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGPSO00116 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGPSO00116 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGPSO00116 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGPSO00116 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGPSO00116 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGPSO00116 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
AGPSO00116 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGPSO00116 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGPSO00116 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGPSO00116 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGPSO00116 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGPSO00116 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGPSO00116 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGPSO00116 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGPSO00116 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
AGPSO00116 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGPSO00116 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGPSO00116 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGPSO00116 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGPSO00116 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGPSO00116 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGPSO00116 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGPSO00116 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AGPSO00116 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGPSO00116 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGPSO00116 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGPSO00116 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGPSO00116 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms