Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
B4DXG7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
B4DXG7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
B4DXG7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
B4DXG7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
B4DXG7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
B4DXG7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
B4DXG7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
B4DXG7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
B4DXG7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
B4DXG7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
B4DXG7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
B4DXG7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
B4DXG7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
B4DXG7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
B4DXG7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
B4DXG7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
B4DXG7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
B4DXG7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
B4DXG7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
B4DXG7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
B4DXG7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
B4DXG7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
B4DXG7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
B4DXG7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
B4DXG7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
B4DXG7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
B4DXG7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
B4DXG7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
B4DXG7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
B4DXG7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
B4DXG7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
B4DXG7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
B4DXG7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
B4DXG7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
B4DXG7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
B4DXG7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
B4DXG7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
B4DXG7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
B4DXG7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
B4DXG7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
B4DXG7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
B4DXG7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
B4DXG7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
B4DXG7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
B4DXG7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
B4DXG7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
B4DXG7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
B4DXG7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
B4DXG7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
B4DXG7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
B4DXG7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
B4DXG7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
B4DXG7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
B4DXG7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
B4DXG7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
B4DXG7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
B4DXG7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
B4DXG7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
B4DXG7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
B4DXG7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
B4DXG7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
B4DXG7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
B4DXG7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
B4DXG7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
B4DXG7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
B4DXG7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
B4DXG7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
B4DXG7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
B4DXG7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
B4DXG7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
B4DXG7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
B4DXG7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
B4DXG7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
B4DXG7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
B4DXG7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
B4DXG7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
B4DXG7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
B4DXG7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
B4DXG7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
B4DXG7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
B4DXG7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
B4DXG7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
B4DXG7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
B4DXG7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
B4DXG7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
B4DXG7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
B4DXG7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
B4DXG7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
B4DXG7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
B4DXG7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
B4DXG7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
B4DXG7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
B4DXG7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
B4DXG7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
B4DXG7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
B4DXG7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
B4DXG7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
B4DXG7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
B4DXG7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms