Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms