Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NOTOA8MTQ0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms