Protein–RNA interactions for Protein: A8K0S8

MEIS3P2, Putative homeobox protein Meis3-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P2A8K0S8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MEIS3P2A8K0S8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MEIS3P2A8K0S8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MEIS3P2A8K0S8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MEIS3P2A8K0S8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MEIS3P2A8K0S8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MEIS3P2A8K0S8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MEIS3P2A8K0S8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MEIS3P2A8K0S8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MEIS3P2A8K0S8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEIS3P2A8K0S8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEIS3P2A8K0S8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEIS3P2A8K0S8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEIS3P2A8K0S8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEIS3P2A8K0S8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEIS3P2A8K0S8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEIS3P2A8K0S8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEIS3P2A8K0S8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEIS3P2A8K0S8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MEIS3P2A8K0S8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEIS3P2A8K0S8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MEIS3P2A8K0S8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEIS3P2A8K0S8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms