Protein–RNA interactions for Protein: A6NMT0

DBX1, Homeobox protein DBX1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBX1A6NMT0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DBX1A6NMT0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DBX1A6NMT0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DBX1A6NMT0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DBX1A6NMT0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DBX1A6NMT0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DBX1A6NMT0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DBX1A6NMT0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DBX1A6NMT0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DBX1A6NMT0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DBX1A6NMT0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DBX1A6NMT0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DBX1A6NMT0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms