Protein–RNA interactions for Protein: A6NFR6

C5orf60, Putative uncharacterized protein C5orf60, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf60A6NFR6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C5orf60A6NFR6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms