Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms