Protein–RNA interactions for Protein: A0PJW6

TMEM223, Transmembrane protein 223, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM223A0PJW6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms