Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms