Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YYE9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0J9YYE9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0J9YYE9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
A0A0J9YYE9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0J9YYE9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0J9YYE9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0J9YYE9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0J9YYE9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0J9YYE9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0J9YYE9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0J9YYE9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0J9YYE9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0J9YYE9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0J9YYE9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms