Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WWV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WWV3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A087WWV3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A087WWV3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A087WWV3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A087WWV3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A087WWV3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A087WWV3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A087WWV3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A087WWV3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A087WWV3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A087WWV3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A087WWV3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A087WWV3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A087WWV3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A087WWV3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A087WWV3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A087WWV3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A087WWV3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A087WWV3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A087WWV3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A087WWV3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A087WWV3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A087WWV3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A087WWV3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A087WWV3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A087WWV3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A087WWV3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A087WWV3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A087WWV3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A087WWV3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
A0A087WWV3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A087WWV3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
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