Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 AC139491.6-202ENST00000637171 2077 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 TUBD1-203ENST00000346141 1490 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 LIPG-205ENST00000580036 1453 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 AC092295.2-201ENST00000592087 1392 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 WFDC2-201ENST00000217425 356 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 PSORS1C2-201ENST00000259845 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 AL365203.1-201ENST00000450890 1048 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 AC020893.2-201ENST00000506083 723 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 RAB30-AS1-205ENST00000530270 1116 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 FAM86B1-215ENST00000533513 725 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 AC011444.2-201ENST00000587759 567 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 AC083841.4-201ENST00000637396 352 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 PAXIP1-AS2-203ENST00000449486 2121 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 PRAMEF20-202ENST00000602960 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 HNRNPC-204ENST00000449098 1599 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 PBDC1-202ENST00000373358 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 CCDC103-203ENST00000410027 571 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 AL355309.1-201ENST00000442158 78 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 BX571846.1-201ENST00000447347 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 NEURL1-AS1-202ENST00000453753 640 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 AC118553.1-201ENST00000454219 655 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 AC104445.1-201ENST00000460597 749 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 MIR2277-201ENST00000515916 93 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 SELENOS-207ENST00000531964 764 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 AC073578.1-201ENST00000535133 493 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 HNRNPA1P69-201ENST00000552536 933 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 NT5CP1-201ENST00000554092 509 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 MIR6750-201ENST00000617817 75 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 LINC00969-263ENST00000626007 839 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 CFAP65-204ENST00000410037 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 HMBS-202ENST00000392841 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 CLK4-208ENST00000520957 1690 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 JPX-207ENST00000602772 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 C10orf128-203ENST00000374153 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 SLC22A6-202ENST00000377871 2151 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 AC106872.1-201ENST00000512492 1360 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 CCDC33-206ENST00000558821 1993 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 RPL15-202ENST00000354811 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 NDUFB8-203ENST00000370322 713 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 MESTP4-201ENST00000412333 1204 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 AC109779.1-202ENST00000439810 579 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 AL669970.2-201ENST00000446184 280 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 LILRB1-AS1-201ENST00000456337 554 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 RN7SL681P-201ENST00000482763 292 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 MIR3177-201ENST00000578255 82 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 CNDP2-228ENST00000584768 897 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 AC012442.3-201ENST00000636053 940 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 PGAP2-235ENST00000532523 1696 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 ATCAY-205ENST00000600960 2904 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 PPARA-202ENST00000402126 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 AL627309.3-201ENST00000495576 1319 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 ELOVL1-202ENST00000413844 1451 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 HINFP-204ENST00000527410 1466 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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