Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 AL049792.1-201ENST00000424708 1262 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 CYP2F2P-201ENST00000437853 1056 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 LINC01046-201ENST00000443719 405 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 AC069181.1-201ENST00000498256 554 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 SNRPF-205ENST00000553192 552 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 NDUFB1-202ENST00000553514 454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 AC009132.1-201ENST00000565194 320 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 AC091941.1-201ENST00000623003 576 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 AC006511.4-201ENST00000631571 561 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 CYP4F12-201ENST00000324632 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 ZNF577-202ENST00000451628 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 LINC02465-203ENST00000513875 1777 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 AL450468.2-201ENST00000565955 1889 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 LIPC-204ENST00000433326 1484 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 TRMT61B-201ENST00000306108 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 CENPK-215ENST00000514814 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 FAM96A-201ENST00000300030 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 TPM3P7-201ENST00000338274 732 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 IL32-204ENST00000396887 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 AC069277.1-201ENST00000433639 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 CYP4F60P-201ENST00000439449 549 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 AC139143.1-201ENST00000441772 1207 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 AC025178.1-201ENST00000503441 834 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 AC089987.3-201ENST00000551847 588 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 AP003096.1-201ENST00000565199 503 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 AC003965.2-201ENST00000577140 265 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 RN7SL5P-201ENST00000581458 321 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 MIR4640-201ENST00000581824 90 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 SMIM22-201ENST00000586005 366 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 CALM3-206ENST00000594523 540 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 FAM231B-201ENST00000600179 510 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 AC021683.4-201ENST00000623348 1099 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 NDEL1-203ENST00000402554 1858 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 CDC25C-202ENST00000348983 1951 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 AC067852.6-201ENST00000591237 1736 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 MEF2C-207ENST00000503554 1345 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 KRT18P45-201ENST00000515347 1333 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 AL109615.2-201ENST00000455005 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 ATAT1-204ENST00000330083 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 OBP2A-202ENST00000342114 607 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 AC244197.2-201ENST00000370438 655 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 ANO7-203ENST00000402530 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 AL355493.1-201ENST00000422707 808 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 MTND6P7-201ENST00000433237 524 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 IQCJ-202ENST00000451172 885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 EEF1GP2-201ENST00000509352 1243 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 AC021755.2-201ENST00000559022 461 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 KRT16P4-202ENST00000580052 362 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 AL138828.1-208ENST00000585946 824 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 SPC25-201ENST00000282074 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 GJB1-202ENST00000374022 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 TACC1-209ENST00000520611 1550 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms