Protein–RNA interactions for Protein: Q93034

CUL5, Cullin-5, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL5Q93034 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 RBM22P2-201ENST00000393978 1814 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 CDCA7L-201ENST00000356195 2915 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 OLAH-203ENST00000378228 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 ITGB1BP1-201ENST00000238091 1772 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 Z97653.2-201ENST00000623057 1418 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 HPGD-204ENST00000504433 1910 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 AP001120.3-201ENST00000585729 489 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 FAM90A28P-201ENST00000596881 489 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 IP6K2-201ENST00000328631 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 DDX19B-208ENST00000563392 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 NDUFAF6-201ENST00000396111 1869 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 SERPING1-202ENST00000340687 1719 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 MKL1-213ENST00000620651 3757 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL5Q93034 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms