Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AXIN2-209ENST00000618960 4060 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AC005154.3-201ENST00000419639 1393 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 OLAH-203ENST00000378228 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 IP6K2-201ENST00000328631 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 CNTNAP2-207ENST00000628930 1944 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 RBM22P2-201ENST00000393978 1814 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 MGLL-202ENST00000398101 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 Z97653.2-201ENST00000623057 1418 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 MRPL36-201ENST00000382647 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 IL2RG-204ENST00000456850 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 CACNA2D2-205ENST00000429770 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 CUL2-210ENST00000626172 4115 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 FARS2-201ENST00000274680 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AC022201.1-201ENST00000452525 577 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms