Protein–RNA interactions for Protein: P61578

ERVK-16, Endogenous retrovirus group K member 16 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-16P61578 TBC1D27-201ENST00000261651 4838 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 ERCC2-204ENST00000391945 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 NEXMIF-201ENST00000055682 11719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 TRO-201ENST00000173898 4647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 MAMLD1-201ENST00000262858 4607 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 BCOR-202ENST00000378444 6358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 AL591926.3-201ENST00000611630 238 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 BEST1-208ENST00000534553 1829 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 SH3BGRL2-201ENST00000369838 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 ARHGAP24-203ENST00000395184 4661 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 YY1AP1-205ENST00000355499 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 ATXN7L3B-201ENST00000519948 7604 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 MRPL44-201ENST00000258383 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 ZNF568-201ENST00000333987 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 CCDC186-201ENST00000369285 2035 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 AL031432.4-201ENST00000641729 2190 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 SCO1-201ENST00000255390 9612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 ALDH1A2-204ENST00000537372 3700 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 PTCH1-209ENST00000437951 8049 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 ZNF606-201ENST00000341164 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 LVRN-202ENST00000395528 4544 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 NSD2-205ENST00000382892 7706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 PHF21B-203ENST00000403565 3586 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 SHANK2-211ENST00000449833 8850 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 SSX2IP-201ENST00000342203 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 TMPO-212ENST00000556029 4242 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 POLR1B-201ENST00000263331 4558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 CHMP4C-201ENST00000297265 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 APOL2-203ENST00000451256 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 AC009336.2-201ENST00000468418 3521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 CC2D1A-208ENST00000589606 3117 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 TIAM2-212ENST00000529824 5262 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 NFE2L1-222ENST00000585291 4390 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 GNG7-201ENST00000382159 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 SPRED2-201ENST00000356388 4097 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms