Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 GMNN-207ENST00000620958 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 AC089987.1-202ENST00000641959 426 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 MYF5-201ENST00000228644 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 SEC22C-205ENST00000417572 1513 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 AL590552.1-201ENST00000623164 1770 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 MASTL-201ENST00000342386 2968 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 TMUB2-214ENST00000590235 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 ZFR2-203ENST00000439086 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 AC113346.2-201ENST00000502684 457 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 AC008761.2-201ENST00000600512 419 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 AC024580.2-201ENST00000623363 231 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 AC068987.3-201ENST00000637934 1195 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 KRT31-201ENST00000251645 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 LINC01551-201ENST00000399387 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 AC034238.1-214ENST00000609699 1590 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 CNTF-201ENST00000361987 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 PIGS-202ENST00000308360 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 PKMP1-201ENST00000455804 1523 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 IL1RAP-210ENST00000434491 1565 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 AL096677.1-201ENST00000442884 814 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 RN7SL313P-201ENST00000497618 288 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 AC104123.1-201ENST00000502645 473 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 HINT1-204ENST00000506908 681 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 MIOXP1-201ENST00000521205 835 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 HP-215ENST00000569639 568 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 AC007608.2-201ENST00000569940 1146 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 CNDP2-228ENST00000584768 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 AL139035.1-202ENST00000626308 565 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 CHD1L-202ENST00000369258 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 CFAP65-204ENST00000410037 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 MED8-201ENST00000290663 1483 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 AK4P5-201ENST00000404520 634 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 AC011890.1-201ENST00000427955 303 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 AL445933.2-201ENST00000440249 265 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 TMEM255B-205ENST00000488362 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 NDUFC2-KCTD14-201ENST00000528251 566 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 TRIAP1-202ENST00000546954 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 AL160313.2-201ENST00000555875 493 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 MPHOSPH6-203ENST00000563504 617 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 AC020728.1-201ENST00000605749 1216 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 TRPV1-201ENST00000310522 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 RPS3-209ENST00000527446 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 DAP3-203ENST00000421487 1470 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 KRT40-201ENST00000377755 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 CTF2P-201ENST00000412003 604 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 AC098934.2-202ENST00000438944 1033 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 AC104333.3-201ENST00000449334 479 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 C2-211ENST00000469372 1906 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 SQSTM1-201ENST00000360718 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 HNRNPA1P19-201ENST00000405292 370 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 SKA1-203ENST00000417656 1095 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 APOBEC3H-203ENST00000421988 592 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 ZNF662-202ENST00000422021 436 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 GAPDHP1-201ENST00000452570 1005 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 AC100830.3-201ENST00000583044 554 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 AC015911.7-201ENST00000587542 958 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 LINC01624-203ENST00000607074 3265 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 SNX10-201ENST00000338523 2546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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