Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 MOG-233ENST00000494692 958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 PRDM2-214ENST00000505823 568 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 OR4A18P-201ENST00000529103 1088 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 ILK-216ENST00000627400 111 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 CNOT4-204ENST00000414802 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 OMA1-201ENST00000371226 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 TDG-201ENST00000266775 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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FAM208BQ5VWN6 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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FAM208BQ5VWN6 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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FAM208BQ5VWN6 MKL1-210ENST00000614754 3917 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 IGHV1-2-201ENST00000390594 417 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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FAM208BQ5VWN6 LINC00158-203ENST00000440205 740 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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FAM208BQ5VWN6 AC091849.2-201ENST00000503113 692 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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FAM208BQ5VWN6 AC073655.1-201ENST00000550111 493 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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FAM208BQ5VWN6 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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FAM208BQ5VWN6 USP4-204ENST00000416417 1536 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAM208BQ5VWN6 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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