Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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HOXA3O43365 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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HOXA3O43365 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HOXA3O43365 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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