Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 ATIC-201ENST00000236959 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 NKAP-201ENST00000371410 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 SEPT4-223ENST00000583114 1709 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 SOX13-203ENST00000367204 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 PPP4R1-202ENST00000400555 3885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 ANKZF1-203ENST00000410034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 KDM3A-216ENST00000542128 4311 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AL031714.1-201ENST00000567829 2926 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 TP53I11-203ENST00000395648 3381 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 FPR2-203ENST00000598953 1544 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 ZNF674-201ENST00000414387 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 SPART-203ENST00000451493 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 CUL4A-204ENST00000451881 3724 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 REV3L-201ENST00000358835 10815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 R3HDM2-215ENST00000634871 4092 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AL391294.1-201ENST00000641352 4068 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 IRS4-201ENST00000372129 3928 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 ERCC5-201ENST00000355739 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 IYD-208ENST00000500320 2158 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 RALGAPB-201ENST00000262879 8663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 RALGAPB-203ENST00000397042 8652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 PARG-207ENST00000616448 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 SIRPG-202ENST00000303415 1716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 SIRPG-204ENST00000381580 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 WDR83OS-202ENST00000596731 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 GPALPP1-202ENST00000361121 3410 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 SYNRG-229ENST00000621136 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 MRPL36-201ENST00000382647 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 WDR62-203ENST00000401500 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 DMKN-203ENST00000402589 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AC097652.1-201ENST00000511385 2114 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 NCAM1-225ENST00000618266 5937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AC008609.1-202ENST00000501818 2686 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 SPECC1-206ENST00000395530 8133 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 RANGAP1-201ENST00000356244 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 DLX5-201ENST00000222598 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 XYLB-203ENST00000427323 1666 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 NRAP-201ENST00000359988 5580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 PEX1-204ENST00000438045 3329 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 IQCB1-202ENST00000349820 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AC008676.1-201ENST00000508443 1932 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 ELP4-212ENST00000638764 2456 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 ATP7B-202ENST00000344297 5861 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 PIK3R5-202ENST00000447110 4495 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 SLFNL1-202ENST00000359345 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 MSH6-213ENST00000614496 4150 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 CAGE1-201ENST00000296742 2821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 GPATCH2L-212ENST00000557263 1458 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AC010997.4-201ENST00000609200 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 NBR1-205ENST00000589872 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 TP53I11-220ENST00000533940 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 SLC39A14-204ENST00000381237 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 VRK3-205ENST00000593919 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 CICP7-201ENST00000432723 2477 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 SOX30-203ENST00000519442 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF10-205ENST00000518288 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 SMARCB1-203ENST00000407082 1182 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms