Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 VPS26A-203ENST00000395098 2554 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 SATB2-AS1-205ENST00000450728 3314 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 AC063952.1-201ENST00000637360 2666 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 ZFP37-203ENST00000555206 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 LILRB1-AS1-201ENST00000456337 554 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 MEF2C-AS1-205ENST00000509179 388 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 AC080023.2-201ENST00000532615 208 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 RHOJ-202ENST00000555125 548 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 DPPA5P4-201ENST00000559021 365 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 MESTP2-201ENST00000559787 889 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 ASMTL-AS1-205ENST00000602357 435 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 AL731555.1-201ENST00000634547 1259 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 ARL14EPL-203ENST00000634632 642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 ANXA3-209ENST00000512884 1335 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 AC105219.4-201ENST00000529743 1809 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 APOC3-201ENST00000227667 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 CCDC70-201ENST00000242819 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 CD74-203ENST00000377795 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 MBD3L2-201ENST00000381393 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 PQLC1P1-201ENST00000434950 429 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 LINC00313-206ENST00000441283 448 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 AC092471.1-201ENST00000536497 572 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 AL162464.2-201ENST00000557761 526 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 GDPD1-205ENST00000581140 1265 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 SCHIP1-201ENST00000445224 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 NTM-201ENST00000374784 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 TESK2-202ENST00000372086 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 HEY2-202ENST00000368365 2461 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 FAM95B1-211ENST00000592053 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 AL669942.1-203ENST00000610972 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 GPHN-202ENST00000459628 1723 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 PES1P1-201ENST00000508165 1736 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 RN7SL307P-201ENST00000490342 295 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 MORF4L1-208ENST00000558746 874 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 AC006236.1-201ENST00000576249 797 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 AC091588.2-201ENST00000578741 366 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 OR4C3-202ENST00000611380 597 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 MIR197-201ENST00000384976 75 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 LINC01128-201ENST00000415295 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 OR7E33P-201ENST00000437705 966 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 RN7SL756P-201ENST00000488739 268 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 AC027237.4-201ENST00000560870 694 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 Metazoa_SRP.186-201ENST00000617234 362 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 MEFV-209ENST00000541159 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 CLU-202ENST00000405140 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 IMPDH1P8-201ENST00000413639 1525 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 AC006262.1-201ENST00000593980 1316 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 HDGF-203ENST00000368209 2171 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 CASC4-202ENST00000345795 3764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 GPR141-201ENST00000334425 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 TROAP-202ENST00000380327 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 GPAT2P2-201ENST00000445404 863 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 AC034229.1-201ENST00000506299 943 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 AL157392.3-218ENST00000600249 773 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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