Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 TMEM94-201ENST00000314256 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 FLNA-202ENST00000360319 8281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 DAG1-218ENST00000515359 5576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 MYO7A-201ENST00000409619 7106 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 NEDD4L-208ENST00000456173 4978 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 CMC2-201ENST00000219400 10301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 REV3L-201ENST00000358835 10815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 SMCR8-201ENST00000406438 8279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 BAIAP2-AS1-202ENST00000577066 4465 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 ZNF629-201ENST00000262525 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
PDLIM3Q53GG5 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
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