Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 MYOZ3-205ENST00000520112 605 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 INMT-MINDY4-202ENST00000458257 2877 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 GP6-203ENST00000417454 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 BRF2-201ENST00000220659 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 LCMT1-AS2-201ENST00000562280 2601 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 TMEM100-205ENST00000575734 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 PRDM2-204ENST00000376048 2688 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 AC018521.1-202ENST00000641877 2655 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 SLAMF7-205ENST00000444090 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 HMOX2-203ENST00000406590 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 TNS2-210ENST00000549700 4525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 SLCO2B1-204ENST00000454962 3219 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 AIFM1P1-201ENST00000413342 1841 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 PABPC1P2-201ENST00000471997 1805 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 AC053503.6-201ENST00000623864 1843 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 GPR132-201ENST00000329797 3660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 ARHGAP27-212ENST00000532038 3694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 MRS2-203ENST00000378386 3313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 MAP3K9-204ENST00000554146 2982 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 NDUFAF6-201ENST00000396111 1869 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 CYP1A1-201ENST00000379727 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 CHID1-204ENST00000449825 3537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 ACTR1A-201ENST00000369905 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 FPGT-202ENST00000370898 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 STK16-204ENST00000409638 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 FUBP1-202ENST00000370767 2524 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 CLIP3-201ENST00000360535 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 CPSF4-206ENST00000441580 942 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 RUNX1T1-227ENST00000520724 2103 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 AC138761.4-202ENST00000577956 2552 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 PLEKHG3-204ENST00000484731 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 DGCR11-201ENST00000609958 2214 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 CRYZ-205ENST00000417775 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 TRAP1-212ENST00000575671 2309 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 JMJD7-PLA2G4B-202ENST00000382448 3331 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 PLEKHM1P1-202ENST00000578036 4318 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 ZNF530-201ENST00000332854 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 ABI1-203ENST00000376137 3467 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 USP20-201ENST00000315480 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 PRPS2-202ENST00000380668 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 ST3GAL6-202ENST00000394162 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 OPRK1-206ENST00000613482 4682 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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