Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 FERMT2-202ENST00000343279 3247 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 NR3C1-204ENST00000394466 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 FAM102A-202ENST00000373084 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 GGTA1P-202ENST00000481534 3429 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 USP2-AS1-202ENST00000500970 1784 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 AL357060.2-202ENST00000606998 1959 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GGCXP38435 GRIK5-202ENST00000301218 3310 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GGCXP38435 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GGCXP38435 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GGCXP38435 TGM7-201ENST00000452443 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GGCXP38435 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GGCXP38435 CSNK1G1-209ENST00000634811 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GGCXP38435 STAT3-202ENST00000389272 2615 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GGCXP38435 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GGCXP38435 CASS4-202ENST00000434344 2888 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GGCXP38435 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GGCXP38435 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GGCXP38435 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GGCXP38435 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GGCXP38435 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GGCXP38435 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GGCXP38435 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GGCXP38435 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GGCXP38435 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GGCXP38435 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GGCXP38435 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GGCXP38435 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GGCXP38435 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GGCXP38435 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GGCXP38435 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GGCXP38435 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GGCXP38435 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GGCXP38435 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GGCXP38435 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GGCXP38435 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GGCXP38435 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GGCXP38435 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GGCXP38435 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GGCXP38435 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GGCXP38435 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GGCXP38435 AC092902.2-210ENST00000468859 1996 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GGCXP38435 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GGCXP38435 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GGCXP38435 SCP2-203ENST00000371514 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GGCXP38435 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GGCXP38435 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GGCXP38435 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GGCXP38435 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GGCXP38435 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGCXP38435 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGCXP38435 ATG10-201ENST00000282185 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGCXP38435 MISP-201ENST00000215582 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGCXP38435 CHIAP2-201ENST00000369743 2829 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGCXP38435 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGCXP38435 ZNF771-204ENST00000566625 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGCXP38435 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGCXP38435 DUSP11-202ENST00000443070 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGCXP38435 HPSE2-202ENST00000370549 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGCXP38435 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGCXP38435 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGCXP38435 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGCXP38435 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGCXP38435 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
GGCXP38435 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGCXP38435 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGCXP38435 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGCXP38435 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGCXP38435 KNDC1-202ENST00000368571 3925 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGCXP38435 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGCXP38435 HIKESHI-201ENST00000278483 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGCXP38435 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGCXP38435 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGCXP38435 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGCXP38435 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGCXP38435 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGCXP38435 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
GGCXP38435 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
GGCXP38435 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGCXP38435 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGCXP38435 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGCXP38435 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGCXP38435 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGCXP38435 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGCXP38435 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGCXP38435 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGCXP38435 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGCXP38435 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGCXP38435 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGCXP38435 IQUB-202ENST00000466202 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms