Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 TNRC6C-201ENST00000301624 9632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 REV3L-201ENST00000358835 10815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 PRTFDC1-201ENST00000320152 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 ZNF621-204ENST00000431278 2613 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 RAB8B-201ENST00000321437 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 APOL2-203ENST00000451256 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 LINC00893-215ENST00000618757 2347 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 RPL32P3-206ENST00000510078 2161 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 MADD-206ENST00000402192 5823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 ZNF667-201ENST00000292069 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 DOCK6-201ENST00000294618 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AL137779.3-201ENST00000553295 729 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 DAXX-203ENST00000414083 2355 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 FBXO5-201ENST00000229758 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 LNP1-201ENST00000383693 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AL122035.2-201ENST00000609125 1870 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 USP33-203ENST00000370793 4502 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 STXBP1-202ENST00000373302 3967 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 WDR66-202ENST00000397454 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 ZNF701-204ENST00000540331 5538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 MCF2L-209ENST00000397036 1544 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 TROVE2-206ENST00000400968 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 TRPV1-201ENST00000310522 2340 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 PLD5-204ENST00000442594 3305 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 KIF3A-208ENST00000618515 3333 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 PLOD2-201ENST00000282903 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 HSD3B2-206ENST00000543831 1783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 DDX19B-208ENST00000563392 1760 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 POU5F2-201ENST00000606183 8418 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 DPYSL5-201ENST00000288699 5209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 TGM3-201ENST00000381458 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 ELN-216ENST00000429192 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
VPREB1P12018 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms