Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 FUNDC1-201ENST00000378045 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 AC010997.2-201ENST00000427610 260 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 AC004889.1-201ENST00000498693 856 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 PAX5-213ENST00000523145 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 AC117834.1-201ENST00000523197 602 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 SEPT4-AS1-203ENST00000580769 1000 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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USP35Q9P2H5 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 UGT1A12P-201ENST00000447084 853 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 HMOX2-213ENST00000575120 1027 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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