Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 SYCE1-201ENST00000303903 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 OR2T27-201ENST00000344889 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 SPINK4-201ENST00000379721 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 PPP1R2P10-201ENST00000393023 595 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 POLR3DP1-201ENST00000398689 1176 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 PHBP11-201ENST00000420550 809 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 ATP6AP2-202ENST00000423649 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 SLC10A7-208ENST00000511374 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 MIR4688-201ENST00000577966 83 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 FAM69A-204ENST00000615519 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 LINC02348-201ENST00000618724 489 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 CEBPZOS-203ENST00000397226 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 DDX6P2-201ENST00000619520 1455 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 IL18BP-202ENST00000337131 1606 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 PEX11B-203ENST00000537888 1632 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 KIR3DL3-201ENST00000291860 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 MPPE1-204ENST00000344987 1831 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 MLPH-202ENST00000338530 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 SCHIP1-201ENST00000445224 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 FAM90A22P-201ENST00000400142 1395 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 TEX33-203ENST00000405091 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 AC011239.1-201ENST00000430988 584 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 AC005042.2-201ENST00000449526 510 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 LDHAL6CP-201ENST00000502352 1142 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 MTND6P4-201ENST00000506002 522 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 RPS23-205ENST00000510019 1019 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 AC092745.1-201ENST00000535746 603 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 AC025257.1-201ENST00000550926 375 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 AC106782.3-201ENST00000563429 258 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 LINC02182-201ENST00000569362 498 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 SMIM22-207ENST00000589721 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 AC011495.2-201ENST00000600665 360 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 AL158032.2-201ENST00000616818 195 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 AC138430.2-201ENST00000624068 504 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 AC116631.1-201ENST00000640685 576 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 AC010182.1-201ENST00000548943 2434 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 SPAG8-201ENST00000340291 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 TFG-202ENST00000418917 1716 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 AP000897.1-201ENST00000584036 1613 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 MDM1-204ENST00000411698 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 RFPL3-201ENST00000249007 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 AC073585.1-201ENST00000368895 1328 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms