Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 AC133555.4-201ENST00000569081 152 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms