Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 KIAA1324-210ENST00000529753 2903 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 PCGF2-204ENST00000616199 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 RDH16-202ENST00000398138 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 CLDN19-201ENST00000296387 2859 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 ZSCAN5DP-201ENST00000600684 1488 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 SARS2-205ENST00000594171 1631 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 ELOVL1-216ENST00000621943 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 PNMA3-203ENST00000619635 3627 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 CCDC138-201ENST00000295124 2383 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 SMIM27-203ENST00000451672 2382 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 ANGEL2-208ENST00000535388 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 AC087164.2-201ENST00000624514 3130 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 HSP90AA1-202ENST00000334701 3510 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 LEPR-201ENST00000344610 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 TRIM31-210ENST00000376734 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 DCLRE1C-208ENST00000378258 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 AC048382.5-201ENST00000618330 3667 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 PTPRN-202ENST00000409251 3622 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 TTC16-201ENST00000373289 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 AC053503.6-201ENST00000623864 1843 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 FOSB-204ENST00000585836 3550 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 SNU13-203ENST00000401959 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 KLC4-201ENST00000259708 2688 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 ALDH4A1-202ENST00000375341 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 LINC00523-206ENST00000556697 2071 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 LINC00662-206ENST00000590523 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCAP28676 LGR6-203ENST00000367278 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCAP28676 PRICKLE1-216ENST00000640132 4278 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCAP28676 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCAP28676 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
GCAP28676 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
GCAP28676 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCAP28676 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCAP28676 PCDHA10-202ENST00000506939 3788 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCAP28676 C1orf216-201ENST00000270815 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCAP28676 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCAP28676 RGS6-202ENST00000355512 1564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCAP28676 TTI2-204ENST00000520636 1588 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCAP28676 ACADL-201ENST00000233710 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCAP28676 VRK3-205ENST00000593919 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCAP28676 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCAP28676 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCAP28676 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCAP28676 OCA2-202ENST00000354638 3186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCAP28676 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCAP28676 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCAP28676 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCAP28676 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCAP28676 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCAP28676 HCG2040054-202ENST00000439182 362 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCAP28676 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
GCAP28676 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCAP28676 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCAP28676 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
GCAP28676 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCAP28676 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCAP28676 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCAP28676 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCAP28676 NEAT1-204ENST00000612303 572 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCAP28676 MFSD12-215ENST00000615613 688 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
GCAP28676 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCAP28676 CYP4F12-201ENST00000324632 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCAP28676 Z98259.1-201ENST00000564261 1697 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
GCAP28676 SLC13A2-201ENST00000314669 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCAP28676 CNTNAP2-207ENST00000628930 1944 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCAP28676 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCAP28676 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCAP28676 DZIP1L-201ENST00000327532 3493 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCAP28676 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCAP28676 AC009533.1-201ENST00000539757 3158 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
GCAP28676 SLC4A1AP-206ENST00000618046 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCAP28676 TNIP1-201ENST00000315050 2785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms