Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 ZCRB1-201ENST00000266529 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 SERPING1-202ENST00000340687 1719 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 AC008764.8-201ENST00000623966 2717 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 ZNF564-201ENST00000339282 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 ARHGEF9-226ENST00000636392 1920 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 HK3-201ENST00000292432 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 ARHGEF9-220ENST00000635729 1761 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 KLF4-206ENST00000610832 1956 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 CEP83-208ENST00000547575 3122 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 PEX1-204ENST00000438045 3329 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 ETAA1-201ENST00000272342 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 AL591926.3-201ENST00000611630 238 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 AC119674.2-203ENST00000642129 1675 ntAPPRIS P5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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