Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CASP4P49662 CCDC163-203ENST00000626657 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CASP4P49662 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CASP4P49662 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CASP4P49662 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CASP4P49662 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CASP4P49662 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CASP4P49662 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CASP4P49662 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CASP4P49662 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CASP4P49662 ZCRB1-201ENST00000266529 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CASP4P49662 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CASP4P49662 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CASP4P49662 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CASP4P49662 PEX5-201ENST00000266563 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CASP4P49662 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CASP4P49662 ANKRD20A7P-201ENST00000402318 2414 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CASP4P49662 AC018904.2-201ENST00000561202 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CASP4P49662 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CASP4P49662 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CASP4P49662 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CASP4P49662 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CASP4P49662 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CASP4P49662 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CASP4P49662 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CASP4P49662 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CASP4P49662 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CASP4P49662 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CASP4P49662 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CASP4P49662 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CASP4P49662 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CASP4P49662 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CASP4P49662 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CASP4P49662 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CASP4P49662 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CASP4P49662 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CASP4P49662 STK40-203ENST00000373130 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CASP4P49662 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CASP4P49662 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CASP4P49662 KIZ-208ENST00000616848 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CASP4P49662 ZFP69B-201ENST00000361584 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CASP4P49662 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CASP4P49662 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CASP4P49662 HMGB1-202ENST00000339872 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CASP4P49662 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CASP4P49662 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CASP4P49662 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CASP4P49662 AC139491.6-202ENST00000637171 2077 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CASP4P49662 CNTNAP2-207ENST00000628930 1944 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CASP4P49662 AC135506.1-201ENST00000603877 1799 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CASP4P49662 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CASP4P49662 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CASP4P49662 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CASP4P49662 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CASP4P49662 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CASP4P49662 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CASP4P49662 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CASP4P49662 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CASP4P49662 VPS33B-202ENST00000535906 2420 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CASP4P49662 Z97653.2-201ENST00000623057 1418 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CASP4P49662 CEP83-208ENST00000547575 3122 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CASP4P49662 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CASP4P49662 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CASP4P49662 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CASP4P49662 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CASP4P49662 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CASP4P49662 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CASP4P49662 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CASP4P49662 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CASP4P49662 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CASP4P49662 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CASP4P49662 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CASP4P49662 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CASP4P49662 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CASP4P49662 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CASP4P49662 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CASP4P49662 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CASP4P49662 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CASP4P49662 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CASP4P49662 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CASP4P49662 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CASP4P49662 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CASP4P49662 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CASP4P49662 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CASP4P49662 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CASP4P49662 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CASP4P49662 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CASP4P49662 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CASP4P49662 ACOX2-201ENST00000302819 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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