Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 CANX-209ENST00000504734 2232 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 BDNF-202ENST00000356660 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 ATP13A2-203ENST00000452699 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 CPPED1-203ENST00000433677 1993 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 ETFBKMT-205ENST00000538463 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 HSD3B2-206ENST00000543831 1783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 KIAA0319-205ENST00000543707 5314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 DCAF6-203ENST00000367843 3302 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 ATP6V0D1-218ENST00000602876 1554 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 LINC01134-203ENST00000442673 3059 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 HJURP-204ENST00000432087 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 MCM4-215ENST00000523944 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 CAMK2A-201ENST00000348628 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 AL359979.2-201ENST00000435108 613 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 FAM95B1-212ENST00000592873 4692 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 FANCC-202ENST00000375305 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 CACNA2D3-AS1-201ENST00000471265 2078 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 ADCK1-202ENST00000341211 1972 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 DDAH1-201ENST00000284031 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 SSX2IP-201ENST00000342203 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 UGT3A1-203ENST00000503189 1902 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 VAT1L-201ENST00000302536 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 LINC00303-201ENST00000367207 1891 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 NDUFAF6-201ENST00000396111 1869 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 LRRC8A-201ENST00000259324 4619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 STRA6-204ENST00000423167 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 ESPNL-203ENST00000409506 3610 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 TMEM200A-201ENST00000296978 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 DOCK3-201ENST00000266037 8755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 PPFIA4-201ENST00000272198 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 CHCHD7-201ENST00000303759 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 BCDIN3D-AS1-201ENST00000548872 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 JAML-211ENST00000533261 1508 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 IWS1-201ENST00000295321 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 KLK2-202ENST00000358049 2847 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 CNTNAP2-201ENST00000361727 9896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 REXO5-201ENST00000261377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 LIG1-201ENST00000263274 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 PCDHGA4-202ENST00000612927 2691 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 TXLNG-202ENST00000398155 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 CDK5RAP3-202ENST00000536708 1975 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 ILF3-219ENST00000590261 3219 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 HCG2040054-202ENST00000439182 362 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 RDH16-202ENST00000398138 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R26P1-201ENST00000474415 3613 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 THUMPD3-206ENST00000452837 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 ERCC6L2-201ENST00000288985 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 ZUFSP-202ENST00000368576 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 DUSP16-201ENST00000228862 3402 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 TRIM68-201ENST00000300747 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 OTUD6B-201ENST00000285420 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 PCDHGA9-201ENST00000573521 4605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms