Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NESP48681 APOL2-203ENST00000451256 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NESP48681 HEBP1-203ENST00000536942 2056 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NESP48681 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NESP48681 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NESP48681 ARPC5-203ENST00000367534 622 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NESP48681 LCE2D-201ENST00000368784 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NESP48681 CDY6P-201ENST00000413320 1266 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NESP48681 BX571846.1-201ENST00000447347 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NESP48681 LSP1P3-201ENST00000449530 208 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NESP48681 AC087752.3-201ENST00000523905 709 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NESP48681 FGF11-205ENST00000575398 990 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NESP48681 AC114488.2-208ENST00000591592 578 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NESP48681 AC121247.1-201ENST00000622888 1232 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NESP48681 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NESP48681 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NESP48681 MED8-201ENST00000290663 1483 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NESP48681 AC004585.2-201ENST00000624090 1473 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NESP48681 MAGED2-205ENST00000375060 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NESP48681 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NESP48681 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NESP48681 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NESP48681 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NESP48681 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NESP48681 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NESP48681 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NESP48681 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NESP48681 MIA-201ENST00000263369 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NESP48681 CNN2P9-201ENST00000417134 909 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NESP48681 RPS18-230ENST00000439602 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NESP48681 RPS18-233ENST00000474973 589 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NESP48681 RN7SL681P-201ENST00000482763 292 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NESP48681 RPL12-205ENST00000536368 499 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NESP48681 C17orf62-210ENST00000577732 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NESP48681 MIA-203ENST00000594436 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NESP48681 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NESP48681 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NESP48681 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NESP48681 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NESP48681 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NESP48681 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NESP48681 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NESP48681 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NESP48681 OXNAD1-206ENST00000605932 1681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NESP48681 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NESP48681 C17orf64-201ENST00000269127 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NESP48681 CDK5-201ENST00000297518 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NESP48681 REG1B-201ENST00000305089 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NESP48681 RN7SKP102-201ENST00000411186 315 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NESP48681 AC004231.1-201ENST00000418393 815 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NESP48681 GAMTP2-201ENST00000430917 463 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NESP48681 AC011995.1-201ENST00000437610 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NESP48681 C10orf71-AS1-201ENST00000437677 753 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NESP48681 AL031432.1-201ENST00000455902 988 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NESP48681 RN7SL292P-201ENST00000473305 266 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NESP48681 PIEZO1P1-201ENST00000485427 219 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NESP48681 TMEM255B-205ENST00000488362 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NESP48681 AC020656.1-201ENST00000548900 599 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NESP48681 AP002478.2-201ENST00000584060 557 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NESP48681 RN7SL217P-201ENST00000584520 286 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NESP48681 AC022146.2-201ENST00000605980 348 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NESP48681 LINC01651-201ENST00000624642 350 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NESP48681 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NESP48681 VPS26A-203ENST00000395098 2554 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NESP48681 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NESP48681 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NESP48681 PMS2CL-202ENST00000403974 1529 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NESP48681 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NESP48681 CREB5-204ENST00000396300 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NESP48681 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NESP48681 HCK-208ENST00000534862 1581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NESP48681 HCK-211ENST00000639405 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NESP48681 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NESP48681 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NESP48681 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NESP48681 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NESP48681 NDUFAF3-201ENST00000326912 705 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NESP48681 MIR219A2-202ENST00000385220 97 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NESP48681 B9D1-204ENST00000395616 733 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NESP48681 LINC00424-201ENST00000413124 654 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NESP48681 AL356481.1-201ENST00000434999 578 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NESP48681 LAMTOR4-207ENST00000474141 519 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NESP48681 AC091965.1-201ENST00000512406 440 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NESP48681 NDUFC2-KCTD14-201ENST00000528251 566 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NESP48681 PTOV1-AS2-201ENST00000593654 596 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NESP48681 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NESP48681 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NESP48681 DAP3-225ENST00000535183 1894 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NESP48681 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NESP48681 SPATA31C1-202ENST00000602681 1927 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NESP48681 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NESP48681 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NESP48681 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NESP48681 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NESP48681 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NESP48681 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NESP48681 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NESP48681 JAML-201ENST00000292067 1959 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NESP48681 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NESP48681 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms