Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 PSMA1-201ENST00000396394 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 IMPDH1P5-201ENST00000439688 1540 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 KATNAL1-202ENST00000380617 1634 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 RBM22P2-201ENST00000393978 1814 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 L3MBTL1-202ENST00000373134 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 ZNF143-202ENST00000396597 1954 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 BX088651.4-202ENST00000428895 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 FCRLA-202ENST00000294796 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 OR51B5-201ENST00000300773 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 RNASE8-201ENST00000308227 634 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 AP000487.2-201ENST00000324630 394 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 NAT8B-201ENST00000377712 765 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 KRTAP10-10-201ENST00000380095 1100 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 AL662860.1-201ENST00000436804 877 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 PLAC9P1-203ENST00000440031 223 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 TMEM154-202ENST00000504064 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 PEBP1P1-201ENST00000554856 510 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 AL157871.2-201ENST00000556212 552 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 NPTN-205ENST00000563691 1214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 SMIM28-201ENST00000573100 855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 RPSAP67-201ENST00000584105 862 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 SRD5A3-AS1-203ENST00000591915 709 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 AL353581.1-201ENST00000606916 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 MIF4GD-214ENST00000618645 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 AL117379.1-201ENST00000619319 677 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 AC134878.2-201ENST00000620700 1265 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 RUSC1-AS1-202ENST00000446880 1836 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 RCL1-206ENST00000442869 1644 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 GABRR2-201ENST00000402938 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 IP6K2-221ENST00000449610 1673 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 SFTPA1-203ENST00000428376 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 OPRM1-210ENST00000452687 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 SLCO2A1-208ENST00000493729 1918 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 AC090403.1-201ENST00000584546 1352 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 OAS1-201ENST00000202917 1816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 MBIP-211ENST00000621657 1809 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 CRYZL1-205ENST00000399442 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 SERPINB8P1-201ENST00000401898 377 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 OR7E37P-201ENST00000421076 897 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 TMEM256P1-201ENST00000430550 340 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 SMCO4-202ENST00000525141 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 AL391832.3-201ENST00000549744 846 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 ATP2A2-211ENST00000552636 529 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 AC090825.2-201ENST00000557959 739 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 NPLOC4-214ENST00000573876 560 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 AL078624.1-201ENST00000604004 547 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 SKINT1L-204ENST00000604015 540 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 PILRB-213ENST00000609309 993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 AL160287.1-203ENST00000637960 1061 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 SYT17-204ENST00000562711 1702 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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