Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 IWS1-201ENST00000295321 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 FAM9A-201ENST00000381003 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 XYLB-203ENST00000427323 1666 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 SERPINB8-209ENST00000636430 1719 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 NDUFAF6-201ENST00000396111 1869 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 NDUFS5-201ENST00000372967 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 NDUFS5-202ENST00000372969 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 FKBP1A-201ENST00000381715 705 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 GGT8P-201ENST00000418938 532 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 LINC00271-202ENST00000436554 655 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 AL365194.1-201ENST00000440032 361 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 AL132656.1-201ENST00000452173 490 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 RN7SL43P-201ENST00000463926 291 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 MYLK-AS1-203ENST00000485162 587 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 TPI1P2-201ENST00000491343 752 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 OCIAD1-226ENST00000513391 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 MAF1-204ENST00000532522 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 AC073610.2-201ENST00000537495 406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 DHRS4L1-201ENST00000558293 855 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 SALL1-204ENST00000566102 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 AC092368.1-201ENST00000568014 733 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 RN7SL238P-201ENST00000613832 290 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 Metazoa_SRP.139-201ENST00000616096 290 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 RN7SL106P-201ENST00000618104 290 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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PTF1AQ7RTS3 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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PTF1AQ7RTS3 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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PTF1AQ7RTS3 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 RGS6-202ENST00000355512 1564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 KRT18P40-201ENST00000599859 1571 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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PTF1AQ7RTS3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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PTF1AQ7RTS3 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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PTF1AQ7RTS3 IQCF6-201ENST00000398780 446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 ACTBP1-201ENST00000417985 1113 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 CYP4F60P-201ENST00000439449 549 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 AC106748.1-201ENST00000454801 384 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 FLNC-AS1-201ENST00000469965 559 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 COPZ1-206ENST00000549043 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 MPI-212ENST00000565576 1148 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 ARL17B-207ENST00000575960 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 AFMID-205ENST00000586731 550 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 AFMID-210ENST00000589256 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 OPN1MW-201ENST00000595290 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 NOSIP-204ENST00000596358 1005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 MEIS2-215ENST00000559561 1442 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 AP000897.1-201ENST00000584036 1613 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 LINC00943-204ENST00000537374 1688 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTF1AQ7RTS3 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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