Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 AC004969.1-201ENST00000471553 578 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 CXXC1P1-202ENST00000489409 1212 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 AL137779.3-201ENST00000553295 729 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 BPIFB1-201ENST00000253354 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 LIMS1-204ENST00000409441 1627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 AL391097.1-201ENST00000432706 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 AC005154.3-201ENST00000419639 1393 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 AKNA-203ENST00000312033 3334 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 DAXX-203ENST00000414083 2355 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 AP001092.1-201ENST00000433606 469 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 FAM213AP2-201ENST00000521579 683 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 NRSN2-206ENST00000608736 712 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 MDC1-209ENST00000613547 830 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 GABRR2-201ENST00000402938 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 MKRN7P-201ENST00000433469 1371 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 ACKR1-202ENST00000368122 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 ZFAND1-201ENST00000220669 1798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 ZFAND1-221ENST00000523096 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 VOPP1-217ENST00000625836 1400 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 CKAP2-202ENST00000378034 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 USMG5-205ENST00000369825 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 OR2T32P-201ENST00000403423 963 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 AC093495.1-201ENST00000420253 1067 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 AC026304.1-201ENST00000597953 561 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 MFSD12-215ENST00000615613 688 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms