Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

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Length 528 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 FRMD6-203ENST00000395718 4828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 EPHB6-211ENST00000619012 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 CUL4A-204ENST00000451881 3724 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 MKL1-212ENST00000618417 1842 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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ASIC1P78348 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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ASIC1P78348 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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ASIC1P78348 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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ASIC1P78348 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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ASIC1P78348 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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ASIC1P78348 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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ASIC1P78348 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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ASIC1P78348 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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ASIC1P78348 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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ASIC1P78348 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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ASIC1P78348 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 DDX19B-208ENST00000563392 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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ASIC1P78348 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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ASIC1P78348 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASIC1P78348 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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