Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 KRTAP19-1-201ENST00000390689 646 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NESP48681 AC005102.1-201ENST00000403118 479 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NESP48681 YBX1P9-201ENST00000441264 679 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NESP48681 AL513283.1-201ENST00000441790 1087 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NESP48681 AC104123.1-201ENST00000502645 473 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NESP48681 LINC00969-247ENST00000608737 956 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NESP48681 FAM236A-202ENST00000611003 403 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NESP48681 AC009542.2-204ENST00000636543 433 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NESP48681 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NESP48681 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NESP48681 NIFK-AS1-202ENST00000414554 1411 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NESP48681 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NESP48681 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NESP48681 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NESP48681 IWS1-201ENST00000295321 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NESP48681 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NESP48681 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NESP48681 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NESP48681 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NESP48681 AMD1P4-201ENST00000299540 1345 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NESP48681 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NESP48681 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NESP48681 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NESP48681 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NESP48681 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NESP48681 ZFP69B-201ENST00000361584 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NESP48681 AC007389.1-202ENST00000377977 1266 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NESP48681 SEPT4-203ENST00000393086 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NESP48681 AL935212.2-201ENST00000419207 718 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NESP48681 AC019185.2-201ENST00000424628 520 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NESP48681 SLC48A1-202ENST00000442892 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NESP48681 AC245164.1-201ENST00000517731 412 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NESP48681 AL157791.2-201ENST00000604758 478 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NESP48681 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NESP48681 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NESP48681 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NESP48681 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NESP48681 KCNAB1-203ENST00000389636 1806 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NESP48681 RAD9B-202ENST00000392672 1846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NESP48681 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NESP48681 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NESP48681 AC092809.4-201ENST00000420350 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NESP48681 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NESP48681 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NESP48681 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NESP48681 TFG-202ENST00000418917 1716 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NESP48681 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NESP48681 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NESP48681 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NESP48681 VRK3-205ENST00000593919 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NESP48681 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NESP48681 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NESP48681 HNRNPA1P34-201ENST00000391992 950 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NESP48681 TIRAP-201ENST00000392678 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NESP48681 VTI1BP2-201ENST00000394154 696 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NESP48681 AL356488.1-201ENST00000429752 609 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NESP48681 TRERNA1-201ENST00000431460 462 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NESP48681 AL669970.2-201ENST00000446184 280 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NESP48681 AL731577.1-201ENST00000449984 830 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NESP48681 AC005220.1-201ENST00000450473 884 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NESP48681 AL645949.2-201ENST00000513434 786 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NESP48681 GFRA2-203ENST00000517892 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NESP48681 ENO1P2-201ENST00000557166 974 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NESP48681 AC125494.1-202ENST00000586338 723 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NESP48681 TSPAN16-204ENST00000590327 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NESP48681 AC084337.2-202ENST00000640959 595 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NESP48681 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NESP48681 ZFP37-203ENST00000555206 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NESP48681 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NESP48681 GSDMB-201ENST00000309481 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NESP48681 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NESP48681 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NESP48681 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NESP48681 EEF2KMT-201ENST00000427587 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NESP48681 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NESP48681 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NESP48681 TACC1-209ENST00000520611 1550 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NESP48681 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NESP48681 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NESP48681 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NESP48681 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NESP48681 C12orf45-201ENST00000280749 459 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NESP48681 MAPT-207ENST00000420682 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NESP48681 MAPT-208ENST00000431008 1233 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NESP48681 CSMD2-AS1-205ENST00000434181 655 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NESP48681 AL354733.3-201ENST00000448389 390 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NESP48681 AC112492.3-201ENST00000457557 1031 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NESP48681 FCGR2C-202ENST00000466542 1070 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NESP48681 ATP6V0CP1-201ENST00000482495 618 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NESP48681 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NESP48681 MIR4689-201ENST00000582517 70 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NESP48681 AC079779.3-201ENST00000588842 1200 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NESP48681 AP000547.3-203ENST00000591299 751 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NESP48681 PABPC1L-207ENST00000372824 2223 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NESP48681 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NESP48681 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NESP48681 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NESP48681 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NESP48681 USP14-208ENST00000582707 1803 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NESP48681 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms