Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 LIN28B-AS1-204ENST00000636951 610 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 ERGIC3-202ENST00000348547 1359 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 ACER1-201ENST00000301452 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 STMN1-206ENST00000455785 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 WDR78-202ENST00000371023 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 SYT17-204ENST00000562711 1702 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 ZNF595-203ENST00000608255 1999 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 APOC3-201ENST00000227667 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 CLNS1A-201ENST00000263309 1172 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 CRYBB2-201ENST00000398215 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 THUMPD1P1-201ENST00000400014 1041 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 SYCE3-201ENST00000402753 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 AC245128.2-201ENST00000412970 284 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 RPL36P20-201ENST00000423702 319 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 KCNK16-203ENST00000425054 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 PTPN2P2-201ENST00000433704 1024 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 GAPDHP1-201ENST00000452570 1005 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 AL139353.1-202ENST00000547378 474 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRMP28827 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 CCRL2-202ENST00000399036 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 AC091807.1-201ENST00000418838 1544 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 CELF4-212ENST00000588597 1444 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 TSPEAR-AS2-201ENST00000330490 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 OBP2A-202ENST00000342114 607 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 RNA5SP248-201ENST00000365602 127 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 RPS8-202ENST00000396651 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 TXNRD3NB-201ENST00000404489 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 RN7SKP218-201ENST00000410222 292 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 AL132709.1-202ENST00000448840 588 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 RPL7AP53-201ENST00000468834 793 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 AC068620.1-201ENST00000470544 798 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 OR1X5P-201ENST00000510464 894 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 OR13C2-201ENST00000542196 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 AC091153.4-201ENST00000570493 480 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 RN7SL732P-201ENST00000581157 300 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 AC008686.1-201ENST00000586894 565 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 UGT3A1-203ENST00000503189 1902 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 UFSP2-201ENST00000264689 1630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 AC026461.4-201ENST00000379816 242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 AL355357.1-203ENST00000402154 639 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 CNN2P9-201ENST00000417134 909 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 CBWD5-208ENST00000429800 1234 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 LINC01046-201ENST00000443719 405 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 AL357060.2-204ENST00000448942 963 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 HTR4-210ENST00000521735 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 AP005018.2-201ENST00000528464 822 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 RAB11A-203ENST00000564910 978 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 AC010524.1-201ENST00000596488 494 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 AL109618.3-201ENST00000622748 430 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 AC135506.1-201ENST00000603877 1799 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 SERINC3-201ENST00000255175 1726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 AC009093.9-201ENST00000566038 1611 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 SARS2-205ENST00000594171 1631 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 ACVR1C-202ENST00000335450 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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