Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 ZNF582-201ENST00000301310 2824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 RGS6-202ENST00000355512 1564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 COX4I2-201ENST00000376075 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 Metazoa_SRP.8-201ENST00000398067 251 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 IL2RG-204ENST00000456850 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 SOX2-OT-203ENST00000466034 926 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 RN7SL677P-201ENST00000466970 319 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 VAMP2-203ENST00000481878 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 AC108112.1-201ENST00000505567 659 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 CCNL2P1-201ENST00000512846 969 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 DERL1-204ENST00000519018 575 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 MRPL51-205ENST00000543164 814 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 MRPL51-206ENST00000543703 441 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 AC005332.2-201ENST00000590010 930 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 SOX2-OT-221ENST00000594942 675 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 AC006273.1-201ENST00000606966 861 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 Z82244.2-201ENST00000632196 448 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 GGPS1-203ENST00000391855 1407 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 AC005549.1-201ENST00000579438 1629 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 A1BG-AS1-203ENST00000594950 1718 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 SLURP1-201ENST00000246515 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 KRT8P6-201ENST00000399259 1207 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 ZNF32-AS2-201ENST00000418966 905 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 CA5BP1-205ENST00000435806 1064 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 AC002066.1-201ENST00000446355 514 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 TRBV11-2-201ENST00000471935 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 PDPN-208ENST00000509009 571 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 AC008808.2-201ENST00000510349 569 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 C8orf37-AS1-203ENST00000521905 617 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 TBX5-AS1-202ENST00000531024 766 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 AC010183.1-201ENST00000552413 559 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 CD276-217ENST00000564751 951 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 IGHV1OR16-3-201ENST00000568138 205 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 AC131274.3-201ENST00000578745 1271 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 NAT9-204ENST00000578822 839 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 AC100778.4-201ENST00000581232 582 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 AC063977.2-201ENST00000601996 421 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 AC245369.8-201ENST00000636589 306 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 CDIPT-AS1-203ENST00000638164 713 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 TAF7L-202ENST00000356784 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 KIR3DL1-203ENST00000391728 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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