Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 WDR43-202ENST00000407426 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 DIS3-205ENST00000545453 3651 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AC022098.1-201ENST00000588387 2861 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 RNF34-203ENST00000392465 2051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 CPT1A-205ENST00000539743 2382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 HEXIM1-201ENST00000332499 3600 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 FAM49B-215ENST00000519824 3798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 CABIN1-201ENST00000263119 7222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 NR1D1-201ENST00000246672 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 GREB1-201ENST00000234142 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 SNAP91-212ENST00000520302 4136 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 IFNAR2-205ENST00000404220 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AL356130.1-201ENST00000620188 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 UBTFL8-201ENST00000426903 2112 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AAGAB-207ENST00000561452 2251 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 PLEKHG5-203ENST00000377728 3613 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 MKL1-213ENST00000620651 3757 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 TNS2-210ENST00000549700 4525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AFAP1L1-201ENST00000296721 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 KMT2A-201ENST00000389506 13655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 PISD-202ENST00000382151 2669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 SUCLG2-201ENST00000307227 2352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 PRAME-203ENST00000402697 2057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 SPAG8-201ENST00000340291 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 ATP7B-203ENST00000400366 6304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 DYNC1I1-205ENST00000447467 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 ADPRH-204ENST00000478399 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 GPT2-202ENST00000440783 4228 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AC093525.7-201ENST00000569852 3626 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 PI4KB-202ENST00000368873 3340 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 PKN2-203ENST00000370521 6121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 SQSTM1-201ENST00000360718 2253 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 GOLGA4-202ENST00000361924 7772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 RBM22P2-201ENST00000393978 1814 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 CACNA1C-213ENST00000399629 6562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 TMEM63B-201ENST00000259746 3318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AIF1L-206ENST00000372302 3340 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AC020741.1-201ENST00000381217 2079 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 PAK1-215ENST00000530617 3001 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 CELF3-202ENST00000290585 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AP002754.1-201ENST00000506329 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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